85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0096 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  100 
 
 		 962 aa  1943    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  58.46 
 
 		 516 aa  432  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  55.66 
 
 		 536 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  46.39 
 
 		 805 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  44.66 
 
 		 463 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  59.52 
 
 		 892 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  62.99 
 
 		 1007 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  50.39 
 
 		 442 aa  300  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  63.39 
 
 		 1120 aa  296  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  61.42 
 
 		 1137 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  61.34 
 
 		 441 aa  282  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  62.6 
 
 		 281 aa  281  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  61.45 
 
 		 320 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  61.11 
 
 		 514 aa  226  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  60 
 
 		 520 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  48.63 
 
 		 790 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  49.02 
 
 		 569 aa  220  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  48.44 
 
 		 791 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  38.51 
 
 		 580 aa  210  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  60.99 
 
 		 280 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  47.21 
 
 		 673 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  65.25 
 
 		 570 aa  147  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  64.29 
 
 		 540 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  57.66 
 
 		 172 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  48.11 
 
 		 473 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  64.29 
 
 		 540 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  62.24 
 
 		 588 aa  117  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  43.48 
 
 		 621 aa  99.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  35.56 
 
 		 399 aa  98.2  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  40.46 
 
 		 689 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  52.04 
 
 		 561 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  40.14 
 
 		 697 aa  85.5  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  51.35 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  56.9 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  55.56 
 
 		 462 aa  80.9  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  52.24 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  47.95 
 
 		 646 aa  78.2  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  40 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  43.53 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  39.39 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  53.45 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  54.24 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  52.63 
 
 		 485 aa  74.3  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  43.59 
 
 		 179 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  43.59 
 
 		 180 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.65 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.18 
 
 		 166 aa  71.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.65 
 
 		 728 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  42.31 
 
 		 177 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 402 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  47.67 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  41.03 
 
 		 176 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 		 196 aa  66.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  27.96 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 183 aa  63.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  43.82 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  59.62 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  60.78 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  59.62 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  59.62 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  72.97 
 
 		 645 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  30.72 
 
 		 472 aa  55.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  39.13 
 
 		 532 aa  55.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  39.13 
 
 		 157 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  55.77 
 
 		 701 aa  53.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  39.73 
 
 		 144 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  55.32 
 
 		 387 aa  52  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  34.58 
 
 		 552 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  37.68 
 
 		 140 aa  50.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  67.65 
 
 		 364 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  24.09 
 
 		 735 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  58.54 
 
 		 469 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  54.55 
 
 		 670 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  54.55 
 
 		 670 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  69.23 
 
 		 408 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  54.84 
 
 		 589 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  28.37 
 
 		 140 aa  47  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  48.28 
 
 		 583 aa  47  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  31.87 
 
 		 1543 aa  45.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  31.15 
 
 		 2906 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  52.08 
 
 		 242 aa  45.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  25.59 
 
 		 654 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2372  hypothetical protein  27.54 
 
 		 305 aa  44.3  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  41.33 
 
 		 536 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>