68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0094 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
1543 aa  3160    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  35.69 
 
 
1051 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  34.02 
 
 
1133 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  33.72 
 
 
1100 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  32.95 
 
 
1101 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  33.17 
 
 
1092 aa  493  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 
3238 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  30.13 
 
 
1341 aa  470  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  36.96 
 
 
3521 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  37.1 
 
 
2900 aa  466  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  36.83 
 
 
3286 aa  463  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  30.05 
 
 
1221 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  36.12 
 
 
2899 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  35.32 
 
 
1103 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  29.59 
 
 
1219 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  35.71 
 
 
3006 aa  439  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  35.59 
 
 
2140 aa  436  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  28.13 
 
 
1816 aa  413  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  29.01 
 
 
1194 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  29.5 
 
 
1158 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  29.5 
 
 
1158 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  31.09 
 
 
1120 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  31.14 
 
 
1137 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  30.66 
 
 
1120 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  30.9 
 
 
1132 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  29.15 
 
 
1157 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  30.9 
 
 
1132 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  30.36 
 
 
1159 aa  399  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  31.67 
 
 
1067 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  28.97 
 
 
1157 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  31.18 
 
 
1132 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  30.29 
 
 
1157 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  29.67 
 
 
2007 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  30.35 
 
 
1159 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  29.74 
 
 
1159 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  29.85 
 
 
1159 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  27.79 
 
 
1188 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  28.79 
 
 
1061 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  29.98 
 
 
1116 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  29.35 
 
 
1116 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  30.35 
 
 
1057 aa  358  5.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  36.45 
 
 
522 aa  342  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  32.48 
 
 
1059 aa  337  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  29.25 
 
 
1012 aa  327  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  26.84 
 
 
881 aa  221  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  36.74 
 
 
951 aa  202  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.53 
 
 
960 aa  168  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  25.94 
 
 
837 aa  162  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  39.69 
 
 
1093 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  39.69 
 
 
1093 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1583  hypothetical protein  38.89 
 
 
1329 aa  85.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  32.14 
 
 
1830 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  27.3 
 
 
779 aa  73.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  30.27 
 
 
348 aa  67.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  28.5 
 
 
2400 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  35.77 
 
 
885 aa  66.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  39.78 
 
 
217 aa  65.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  20.6 
 
 
1644 aa  64.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  28.29 
 
 
885 aa  62  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0298  hypothetical protein  26.83 
 
 
1570 aa  58.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620939  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  19.2 
 
 
918 aa  57.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  22.61 
 
 
1240 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3503  hypothetical protein  25.13 
 
 
404 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  23.71 
 
 
1171 aa  49.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  39.66 
 
 
1221 aa  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  39.66 
 
 
1221 aa  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2176  hypothetical protein  23.9 
 
 
971 aa  46.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3894  sensor histidine kinase  24.55 
 
 
543 aa  45.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>