24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5540 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  97.24 
 
 
1159 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  96.31 
 
 
951 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  96.31 
 
 
1157 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  96.31 
 
 
1157 aa  437  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  95.85 
 
 
1158 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  95.85 
 
 
1158 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  96.77 
 
 
1012 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  94.47 
 
 
1159 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  94.47 
 
 
1157 aa  428  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  93.55 
 
 
881 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  71.17 
 
 
1132 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  68.02 
 
 
1159 aa  299  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  67.57 
 
 
837 aa  299  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  67.57 
 
 
1159 aa  298  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  58.99 
 
 
1132 aa  244  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  58.99 
 
 
1132 aa  244  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  55.22 
 
 
1137 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  60.98 
 
 
1120 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  60.98 
 
 
1116 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  60.98 
 
 
1120 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  60.98 
 
 
1116 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  39.78 
 
 
1543 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  30.88 
 
 
779 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>