60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1353 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  56.41 
 
 		 1093 aa  896    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  56.54 
 
 		 1093 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  60.21 
 
 		 2400 aa  843    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  100 
 
 		 1830 aa  3686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  86.58 
 
 		 2007 aa  2157    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  29.51 
 
 		 1915 aa  128  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  28.3 
 
 		 934 aa  119  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  36.02 
 
 		 1194 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1133 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1100 aa  110  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  31.97 
 
 		 1341 aa  109  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1092 aa  108  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  37.99 
 
 		 1101 aa  106  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  45.76 
 
 		 1816 aa  101  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  38.79 
 
 		 1188 aa  100  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  35.75 
 
 		 1051 aa  95.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1221 aa  90.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1221 aa  90.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  32.97 
 
 		 1219 aa  87  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.15 
 
 		 1221 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1153 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  35.52 
 
 		 1067 aa  79.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  25.89 
 
 		 1135 aa  77.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  29.2 
 
 		 1059 aa  76.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  32.14 
 
 		 1543 aa  76.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  34.97 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  38.54 
 
 		 881 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1158 aa  71.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1158 aa  71.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  38.54 
 
 		 1012 aa  71.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1159 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  26.58 
 
 		 1157 aa  69.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1157 aa  69.3  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  38.54 
 
 		 951 aa  68.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  34.51 
 
 		 1159 aa  67  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1159 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1159 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  30.3 
 
 		 1120 aa  66.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  26.49 
 
 		 837 aa  65.9  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1157 aa  65.9  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  37.5 
 
 		 1116 aa  65.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  29.7 
 
 		 1120 aa  65.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  37.5 
 
 		 1116 aa  64.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  24.26 
 
 		 590 aa  64.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  26.07 
 
 		 771 aa  62.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1132 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1137 aa  58.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2488  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.86 
 
 		 1120 aa  58.9  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1132 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  28.42 
 
 		 1132 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  25.99 
 
 		 885 aa  58.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  25.99 
 
 		 885 aa  58.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  23.51 
 
 		 1564 aa  57  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  30.95 
 
 		 1061 aa  56.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2933  phage minor structural protein  24.85 
 
 		 1496 aa  51.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0509957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  22.99 
 
 		 733 aa  48.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  27.44 
 
 		 849 aa  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1253 aa  47.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.41 
 
 		 9585 aa  47.8  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3534  hypothetical protein  59.46 
 
 		 1438 aa  45.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>