54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2374 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  46.4 
 
 
1051 aa  905    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  54.37 
 
 
1816 aa  983    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  53.96 
 
 
2007 aa  930    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  96.55 
 
 
348 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
1067 aa  2189    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  41.76 
 
 
1100 aa  848    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  53.2 
 
 
1188 aa  930    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  52.79 
 
 
1221 aa  929    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  58.68 
 
 
1061 aa  1255    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  52.55 
 
 
1219 aa  926    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  44.11 
 
 
1101 aa  851    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  44.21 
 
 
1092 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  36.43 
 
 
1133 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  40.65 
 
 
1057 aa  662    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  55.56 
 
 
1194 aa  952    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  54.25 
 
 
1341 aa  986    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.07 
 
 
1059 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  34.11 
 
 
1103 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  34.41 
 
 
3238 aa  416  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  30.64 
 
 
1159 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  35.2 
 
 
3286 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  34.27 
 
 
2899 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  34.45 
 
 
3521 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  32.73 
 
 
2140 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  30.6 
 
 
1159 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  33.57 
 
 
2900 aa  406  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 
3006 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  30.82 
 
 
1157 aa  403  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  31.67 
 
 
1543 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  30.54 
 
 
1158 aa  396  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  30.54 
 
 
1158 aa  396  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  30.53 
 
 
1159 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  30.53 
 
 
1159 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  29.84 
 
 
1137 aa  389  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  29.74 
 
 
1132 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  29.44 
 
 
1132 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  29.44 
 
 
1132 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  29.72 
 
 
1157 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  29.76 
 
 
1157 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  29.82 
 
 
1116 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  31.63 
 
 
1116 aa  373  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  29.2 
 
 
1120 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  29.1 
 
 
1120 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  30.7 
 
 
1012 aa  335  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  36.2 
 
 
522 aa  310  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  30.08 
 
 
881 aa  251  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  34.87 
 
 
951 aa  183  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  27.3 
 
 
837 aa  181  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  24.84 
 
 
960 aa  158  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  34.2 
 
 
1093 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  34.2 
 
 
1093 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  36.42 
 
 
1830 aa  78.2  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  26.42 
 
 
1089 aa  60.1  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.15 
 
 
1644 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>