25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1764 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1561    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  26.62 
 
 		 702 aa  162  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  25.97 
 
 		 694 aa  124  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  24.85 
 
 		 733 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  24.26 
 
 		 590 aa  97.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  26.9 
 
 		 1915 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  26.06 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  26.87 
 
 		 2400 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1830 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2739  hypothetical protein  22.57 
 
 		 657 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  24.53 
 
 		 1093 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  25.33 
 
 		 1093 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  23.56 
 
 		 680 aa  55.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  23.56 
 
 		 680 aa  55.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  32.41 
 
 		 2900 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  24.77 
 
 		 1135 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  28.36 
 
 		 3521 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  30.99 
 
 		 3286 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  26 
 
 		 3238 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  30.61 
 
 		 2899 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3503  hypothetical protein  31.36 
 
 		 404 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  34.48 
 
 		 1341 aa  45.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1235  hypothetical protein  22.76 
 
 		 716 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  35.96 
 
 		 1816 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  28.08 
 
 		 2140 aa  44.3  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>