32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1994 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  100 
 
 		 1564 aa  3160    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  41 
 
 		 849 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1153 aa  326  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1221 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1221 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  32.47 
 
 		 1253 aa  300  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  26.94 
 
 		 3521 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  26.51 
 
 		 2900 aa  146  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  30.85 
 
 		 3006 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  26.5 
 
 		 2899 aa  133  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  32.08 
 
 		 3286 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  26.32 
 
 		 2140 aa  125  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  26.08 
 
 		 3238 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  36.79 
 
 		 425 aa  108  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  36.17 
 
 		 287 aa  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  26.75 
 
 		 885 aa  99.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  25.77 
 
 		 885 aa  95.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  29.61 
 
 		 729 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  23 
 
 		 680 aa  72.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  24.07 
 
 		 1915 aa  72  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  22.8 
 
 		 680 aa  69.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25.18 
 
 		 2196 aa  63.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  22.88 
 
 		 1093 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1850  hypothetical protein  30.39 
 
 		 417 aa  60.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  22.66 
 
 		 1093 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1830 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1851  hypothetical protein  39.36 
 
 		 270 aa  53.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459823  normal  0.905068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4217  hypothetical protein  41.94 
 
 		 284 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0139  hypothetical protein  47.14 
 
 		 376 aa  49.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000041026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  21.89 
 
 		 2400 aa  48.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  26.24 
 
 		 934 aa  48.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  34.21 
 
 		 1115 aa  47.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>