47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3156 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  100 
 
 		 934 aa  1920    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  36.29 
 
 		 1915 aa  148  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  31.54 
 
 		 590 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1830 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  27.69 
 
 		 1093 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  27.95 
 
 		 1093 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  27.95 
 
 		 2400 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  33.94 
 
 		 1135 aa  98.2  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  27.39 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  28.19 
 
 		 702 aa  80.9  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  27.39 
 
 		 733 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  25.72 
 
 		 771 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1221 aa  64.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1221 aa  64.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  26.86 
 
 		 1059 aa  60.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  25.16 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  24.84 
 
 		 680 aa  57  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1235  hypothetical protein  25.83 
 
 		 716 aa  57  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1253 aa  55.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1159 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  27.45 
 
 		 1159 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  27.45 
 
 		 1132 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  27.04 
 
 		 1188 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1132 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  27.45 
 
 		 1012 aa  52  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  26.94 
 
 		 1116 aa  51.6  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1157 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  26.48 
 
 		 1116 aa  50.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1137 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1157 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1159 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1159 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  25.87 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2739  hypothetical protein  25 
 
 		 657 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  26.24 
 
 		 1564 aa  49.7  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1158 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1158 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  26.81 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  26.81 
 
 		 1221 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  31.25 
 
 		 1057 aa  47.8  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  28.38 
 
 		 1120 aa  47.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  24.88 
 
 		 1157 aa  47.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  28.38 
 
 		 1120 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  26.43 
 
 		 881 aa  45.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1153 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6201  hypothetical protein  26.21 
 
 		 721 aa  44.3  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>