57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1639 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  73.44 
 
 
1157 aa  1366    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  96.25 
 
 
1159 aa  1767    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  96.25 
 
 
1159 aa  1766    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  78.21 
 
 
1132 aa  1409    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  96.82 
 
 
1012 aa  1767    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  59.89 
 
 
1116 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  70.68 
 
 
1120 aa  1110    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  60.7 
 
 
1116 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  71.08 
 
 
1120 aa  1113    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  76.77 
 
 
1137 aa  1382    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  82.63 
 
 
1157 aa  1533    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  81.26 
 
 
1132 aa  1476    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  83.2 
 
 
951 aa  1121    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  85.93 
 
 
1158 aa  1588    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  67.7 
 
 
837 aa  1186    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  68.85 
 
 
1159 aa  1276    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  69.19 
 
 
1159 aa  1280    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  82.52 
 
 
1157 aa  1528    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  85.93 
 
 
1158 aa  1588    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  78.21 
 
 
1132 aa  1409    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
881 aa  1823    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  93.55 
 
 
217 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  79.65 
 
 
522 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  32.86 
 
 
1059 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  32.19 
 
 
1051 aa  299  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  29.46 
 
 
1100 aa  281  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  29.57 
 
 
1101 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  29.43 
 
 
1092 aa  266  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  33.02 
 
 
1133 aa  255  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  32.3 
 
 
1221 aa  254  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  32.01 
 
 
1219 aa  254  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  30.08 
 
 
1067 aa  251  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  31.2 
 
 
1816 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  35.81 
 
 
3286 aa  231  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  35.35 
 
 
3238 aa  231  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  27.88 
 
 
1061 aa  230  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  35.21 
 
 
2899 aa  225  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  34.45 
 
 
2900 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  34.68 
 
 
3521 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  30.3 
 
 
1341 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  27.34 
 
 
1543 aa  220  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  34.68 
 
 
3006 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  34.09 
 
 
2140 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.19 
 
 
1103 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  36.31 
 
 
1057 aa  203  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  28.86 
 
 
1194 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  27.98 
 
 
1188 aa  195  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  27.88 
 
 
2007 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.23 
 
 
960 aa  95.9  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  31.89 
 
 
1644 aa  84  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  30.21 
 
 
1093 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  40.4 
 
 
1093 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  38.54 
 
 
1830 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  24.7 
 
 
779 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  28.57 
 
 
2400 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  25.57 
 
 
348 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  26.43 
 
 
934 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>