59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0663 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  100 
 
 
1059 aa  2172    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  36.56 
 
 
1159 aa  634  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  36.09 
 
 
1159 aa  626  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  41.42 
 
 
1137 aa  625  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  41.18 
 
 
1132 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  40.33 
 
 
1120 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  40.21 
 
 
1120 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  40.64 
 
 
1132 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  40.64 
 
 
1132 aa  611  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  35.92 
 
 
1157 aa  609  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  39.93 
 
 
1116 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  39.93 
 
 
1116 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  35.66 
 
 
1159 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  36.41 
 
 
1158 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  36.41 
 
 
1158 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  35.66 
 
 
1159 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  34.34 
 
 
1157 aa  595  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  34.06 
 
 
1157 aa  595  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  35.13 
 
 
1012 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  31.64 
 
 
1061 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  31.27 
 
 
1100 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  32.3 
 
 
1092 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  31.41 
 
 
1051 aa  459  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  32 
 
 
1101 aa  459  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  31.07 
 
 
1067 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  44.31 
 
 
522 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  30.02 
 
 
1133 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  33.6 
 
 
1103 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  32.86 
 
 
881 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  32.22 
 
 
2140 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  32.41 
 
 
3006 aa  349  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  32.27 
 
 
3238 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  29.55 
 
 
1219 aa  344  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.42 
 
 
1221 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  29.72 
 
 
1816 aa  341  5e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  32.48 
 
 
1543 aa  337  7.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  29.95 
 
 
1341 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  31.33 
 
 
3521 aa  335  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  28.2 
 
 
2007 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  31.49 
 
 
2899 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  31.19 
 
 
3286 aa  332  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  31.48 
 
 
2900 aa  330  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  29.66 
 
 
1057 aa  326  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  31.95 
 
 
1188 aa  324  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  27.49 
 
 
1194 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  31.47 
 
 
837 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  43.83 
 
 
951 aa  267  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  27.15 
 
 
960 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  34.63 
 
 
348 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  29.2 
 
 
1830 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  21.82 
 
 
1644 aa  77  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  30.94 
 
 
1093 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  30.94 
 
 
1093 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  25.79 
 
 
2400 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2984  tail fiber protein  23.94 
 
 
1111 aa  61.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  26.86 
 
 
934 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  21.88 
 
 
918 aa  56.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  24.69 
 
 
1915 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  24.93 
 
 
1171 aa  46.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>