26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00838 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1564    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3503  hypothetical protein  35.63 
 
 		 404 aa  107  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  22.62 
 
 		 1543 aa  79  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1132 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  26.92 
 
 		 1132 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1132 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1137 aa  61.6  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1159 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  24.52 
 
 		 1012 aa  56.6  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  24.7 
 
 		 881 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1158 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1158 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  25.73 
 
 		 1159 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  24.14 
 
 		 1157 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  24.14 
 
 		 951 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1157 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  29.7 
 
 		 694 aa  51.6  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  27.31 
 
 		 1116 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  27.46 
 
 		 1120 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  27.09 
 
 		 1116 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  27.46 
 
 		 1120 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1157 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1159 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1159 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  25.55 
 
 		 837 aa  45.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  30.88 
 
 		 217 aa  45.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>