60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1878 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  73.37 
 
 
1132 aa  1781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  84.47 
 
 
1159 aa  2061    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  84.12 
 
 
1159 aa  2054    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  92.83 
 
 
1157 aa  2237    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  70.84 
 
 
1132 aa  1702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  63.39 
 
 
1116 aa  1358    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  69.53 
 
 
1120 aa  1495    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  64.17 
 
 
1116 aa  1377    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  69.73 
 
 
1120 aa  1497    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  70.74 
 
 
1137 aa  1696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  87.82 
 
 
1157 aa  2117    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  85.47 
 
 
1012 aa  1819    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  90.91 
 
 
951 aa  1213    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  100 
 
 
1158 aa  2393    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  78.15 
 
 
837 aa  1339    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  98.02 
 
 
522 aa  1038    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  83.42 
 
 
1159 aa  1993    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  82.99 
 
 
1159 aa  1983    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  93.87 
 
 
1157 aa  2259    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  100 
 
 
1158 aa  2393    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  70.84 
 
 
1132 aa  1702    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  85.93 
 
 
881 aa  1588    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  36.41 
 
 
1059 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  34.59 
 
 
1051 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  95.85 
 
 
217 aa  436  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  31.36 
 
 
1100 aa  436  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  31.61 
 
 
1101 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  34.73 
 
 
1133 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  31.17 
 
 
1092 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  30.51 
 
 
1543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  35.55 
 
 
1103 aa  406  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  30.54 
 
 
1067 aa  396  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  36.73 
 
 
3521 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  36.6 
 
 
3238 aa  393  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.11 
 
 
1221 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  32.92 
 
 
1219 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  36.33 
 
 
2900 aa  386  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  36.82 
 
 
2899 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  36.05 
 
 
3286 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  29.42 
 
 
1061 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  35.18 
 
 
3006 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  34.81 
 
 
2140 aa  370  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  30.73 
 
 
1816 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  30.5 
 
 
1341 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  31.34 
 
 
1194 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  30.19 
 
 
1188 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  29.77 
 
 
2007 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  33.1 
 
 
1057 aa  313  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.38 
 
 
960 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  26.97 
 
 
1644 aa  98.2  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  29.59 
 
 
1093 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  40.4 
 
 
1093 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  38.54 
 
 
1830 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.12 
 
 
918 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  24.58 
 
 
779 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6657  hypothetical protein  22.77 
 
 
782 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  25.37 
 
 
934 aa  48.5  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  25.24 
 
 
348 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  26.92 
 
 
2400 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  20.13 
 
 
1171 aa  46.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>