52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2168 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  98.41 
 
 
1157 aa  1040    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  78.17 
 
 
1159 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  78.57 
 
 
1159 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  96.63 
 
 
1157 aa  1027    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  78.57 
 
 
1132 aa  860    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  77.93 
 
 
1120 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  72.62 
 
 
1116 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  78.13 
 
 
1120 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  79.76 
 
 
1137 aa  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  72.82 
 
 
1116 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  78.37 
 
 
1132 aa  861    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  98.02 
 
 
1158 aa  1038    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  100 
 
 
522 aa  1085    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  97.62 
 
 
1159 aa  1040    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  98.02 
 
 
1159 aa  1042    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  97.62 
 
 
1157 aa  1036    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  98.02 
 
 
1158 aa  1038    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  78.57 
 
 
1132 aa  860    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  79.55 
 
 
1012 aa  630  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  98.03 
 
 
951 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  44.31 
 
 
1059 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  79.65 
 
 
881 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  99.45 
 
 
837 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  41.9 
 
 
1051 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  41.13 
 
 
1103 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  40.73 
 
 
1133 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  36.45 
 
 
1543 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  39.61 
 
 
3238 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  39.43 
 
 
1100 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  39.61 
 
 
3521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  37.28 
 
 
1221 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  39.42 
 
 
2899 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  37.28 
 
 
1219 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  38.64 
 
 
2900 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  39.29 
 
 
1092 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  39.63 
 
 
1101 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  38.4 
 
 
2140 aa  329  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  38.32 
 
 
3006 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  37.13 
 
 
1061 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  38.39 
 
 
3286 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  36.2 
 
 
1067 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  35.61 
 
 
1816 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  35.31 
 
 
1341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  35.4 
 
 
1188 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  35.8 
 
 
1057 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  35.41 
 
 
1194 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  34.39 
 
 
2007 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  28.97 
 
 
960 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  26.64 
 
 
1644 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  21.17 
 
 
918 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  25.87 
 
 
934 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  29.21 
 
 
1915 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>