49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3498 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  100 
 
 
960 aa  1964    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  27.32 
 
 
1219 aa  190  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  27.46 
 
 
1221 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  27.2 
 
 
1101 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  27.07 
 
 
1092 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  26.98 
 
 
1116 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  26.78 
 
 
1157 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  26.72 
 
 
1116 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  26.38 
 
 
1158 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  26.38 
 
 
1158 aa  175  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  27.03 
 
 
1157 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  26.9 
 
 
1061 aa  174  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  27.01 
 
 
1159 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  26.88 
 
 
1159 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  27.7 
 
 
1133 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  25.2 
 
 
1341 aa  170  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  27.15 
 
 
1059 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  25.27 
 
 
1816 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  26.53 
 
 
1543 aa  168  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  28.97 
 
 
522 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  25.95 
 
 
1159 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  25.95 
 
 
1137 aa  166  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  25.79 
 
 
1188 aa  166  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  26.41 
 
 
1051 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  26.59 
 
 
1132 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  26.59 
 
 
1132 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  25.75 
 
 
1132 aa  164  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  25.41 
 
 
1100 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  26.61 
 
 
1157 aa  162  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  26.83 
 
 
1120 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  26.43 
 
 
1159 aa  160  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  25.23 
 
 
1120 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  24.84 
 
 
1067 aa  158  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  26.12 
 
 
3238 aa  156  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  26.21 
 
 
3286 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  24.7 
 
 
1194 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  26.34 
 
 
2899 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  25.7 
 
 
2007 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
3006 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  25.84 
 
 
2900 aa  145  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  25.77 
 
 
3521 aa  144  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  25.24 
 
 
1103 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  24.55 
 
 
1057 aa  143  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  25.99 
 
 
1012 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  26.13 
 
 
2140 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  29.02 
 
 
951 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  25.23 
 
 
881 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  24.44 
 
 
837 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.03 
 
 
1644 aa  52  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>