54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1802 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  83.46 
 
 
1157 aa  1110    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  85.52 
 
 
1159 aa  1150    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  82.9 
 
 
1159 aa  1120    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  98.92 
 
 
1157 aa  1314    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  85.52 
 
 
1012 aa  1144    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  59.94 
 
 
1132 aa  775    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  83.2 
 
 
881 aa  1121    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  58.46 
 
 
1137 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  64.22 
 
 
1132 aa  846    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  100 
 
 
951 aa  1960    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  90.91 
 
 
1158 aa  1213    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  73.97 
 
 
837 aa  975    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  74.27 
 
 
1159 aa  975    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  73.81 
 
 
1159 aa  971    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  99.07 
 
 
1157 aa  1312    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  90.91 
 
 
1158 aa  1213    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  59.94 
 
 
1132 aa  775    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  59.69 
 
 
1120 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  98.03 
 
 
522 aa  623  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  59.5 
 
 
1120 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  55.71 
 
 
1116 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  55.13 
 
 
1116 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  96.31 
 
 
217 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  43.83 
 
 
1059 aa  267  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  42.57 
 
 
1103 aa  232  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  42 
 
 
1051 aa  221  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  36.54 
 
 
1543 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  38.33 
 
 
1133 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  38.49 
 
 
3238 aa  201  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  38.49 
 
 
3521 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  38.98 
 
 
1100 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  38.17 
 
 
2899 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  37.85 
 
 
2900 aa  196  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  36.04 
 
 
1061 aa  194  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  36.91 
 
 
3286 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  36.04 
 
 
3006 aa  189  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  36.04 
 
 
2140 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  39.73 
 
 
1101 aa  187  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  39.39 
 
 
1092 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  35.71 
 
 
1188 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  34.87 
 
 
1067 aa  183  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  35.64 
 
 
1341 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  36.6 
 
 
1194 aa  182  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  35.64 
 
 
1816 aa  182  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  34.2 
 
 
1221 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  35.39 
 
 
2007 aa  178  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  34.31 
 
 
1219 aa  177  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  33.01 
 
 
1057 aa  153  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  29.02 
 
 
960 aa  96.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  41.41 
 
 
1093 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  41.41 
 
 
1093 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  38.54 
 
 
1830 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  29.67 
 
 
2400 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  24.14 
 
 
779 aa  53.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>