57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2167 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  88.7 
 
 
1157 aa  1525    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  67.58 
 
 
1159 aa  1180    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  67.22 
 
 
1159 aa  1176    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  59.86 
 
 
1132 aa  1022    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  67.81 
 
 
1012 aa  1182    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  58.22 
 
 
1116 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  59.74 
 
 
1120 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  58.92 
 
 
1116 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  59.89 
 
 
1120 aa  860    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  60.24 
 
 
1137 aa  1026    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  78.72 
 
 
1157 aa  1357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  70.88 
 
 
1132 aa  1226    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  73.97 
 
 
951 aa  975    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  78.15 
 
 
1158 aa  1339    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  100 
 
 
837 aa  1726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  99.76 
 
 
1159 aa  1719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  99.52 
 
 
1159 aa  1714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  79.55 
 
 
1157 aa  1370    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  78.15 
 
 
1158 aa  1339    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  59.86 
 
 
1132 aa  1022    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  67.7 
 
 
881 aa  1186    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  99.45 
 
 
522 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.47 
 
 
1059 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  67.57 
 
 
217 aa  299  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  27.89 
 
 
1100 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  28.88 
 
 
1051 aa  205  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  26.97 
 
 
1101 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  26.83 
 
 
1092 aa  191  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  27.3 
 
 
1067 aa  181  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  34.29 
 
 
1219 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.68 
 
 
1221 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  25.93 
 
 
1061 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  29.37 
 
 
1133 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  33.25 
 
 
2900 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  33.5 
 
 
3238 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  25.94 
 
 
1543 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  27.73 
 
 
1816 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  33.92 
 
 
2899 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 
3286 aa  161  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  33.5 
 
 
3521 aa  160  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  27.26 
 
 
1341 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  30 
 
 
1103 aa  154  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  31.65 
 
 
2140 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  31.98 
 
 
3006 aa  151  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  26.92 
 
 
1194 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  26.26 
 
 
2007 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  34.41 
 
 
1057 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  28.21 
 
 
1188 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  29.55 
 
 
1644 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  43 
 
 
1093 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  43 
 
 
1093 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  24.44 
 
 
960 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  26.49 
 
 
1830 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  29.63 
 
 
2400 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  25.69 
 
 
348 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  25.55 
 
 
779 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4942  peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 
558 aa  44.3  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>