58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0708 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  65.62 
 
 
1157 aa  1407    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  72.98 
 
 
1159 aa  1573    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  73.85 
 
 
1159 aa  1590    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  69.24 
 
 
1157 aa  1488    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  78.44 
 
 
1132 aa  1661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  75.04 
 
 
1116 aa  1751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  98.57 
 
 
1120 aa  2283    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  75.04 
 
 
1116 aa  1758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  100 
 
 
1120 aa  2311    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  78.64 
 
 
1137 aa  1660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  72.78 
 
 
1012 aa  1344    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  78.54 
 
 
1132 aa  1662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  69.73 
 
 
1158 aa  1497    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  59.89 
 
 
837 aa  860    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  78.13 
 
 
522 aa  845    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  65.85 
 
 
1159 aa  1402    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  65.76 
 
 
1159 aa  1400    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  68.98 
 
 
1157 aa  1479    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  69.73 
 
 
1158 aa  1497    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  78.44 
 
 
1132 aa  1661    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  71.08 
 
 
881 aa  1113    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  59.69 
 
 
951 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  40.33 
 
 
1059 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  32.41 
 
 
1051 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  33.49 
 
 
1100 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  32.54 
 
 
1133 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  36.54 
 
 
3238 aa  403  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  30.66 
 
 
1543 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  39.17 
 
 
2899 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  39.01 
 
 
2900 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  39.01 
 
 
3521 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  33.76 
 
 
1092 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  34.29 
 
 
1103 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  35.99 
 
 
3286 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  33.37 
 
 
1101 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  31.67 
 
 
1221 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  31.58 
 
 
1219 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  31.74 
 
 
1816 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  34.75 
 
 
3006 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  34.98 
 
 
2140 aa  376  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  30.86 
 
 
1341 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  29.1 
 
 
1067 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  33.94 
 
 
1061 aa  366  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  32.42 
 
 
1194 aa  364  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  30.97 
 
 
2007 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  30.8 
 
 
1188 aa  346  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  33.44 
 
 
1057 aa  319  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.83 
 
 
960 aa  160  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  60.98 
 
 
217 aa  102  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  26.32 
 
 
1644 aa  98.6  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  30.82 
 
 
1093 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  30.82 
 
 
1093 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.42 
 
 
918 aa  68.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  30.3 
 
 
1830 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  27.46 
 
 
779 aa  48.9  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  28.12 
 
 
2400 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  31.06 
 
 
1225 aa  47.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  28.38 
 
 
934 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>