57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1694 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  55.76 
 
 		 1051 aa  1176    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  48.7 
 
 		 1341 aa  807    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  48.11 
 
 		 1816 aa  797    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  44.21 
 
 		 2007 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  41.69 
 
 		 1194 aa  877    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  54.5 
 
 		 1133 aa  1206    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  100 
 
 		 1092 aa  2211    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  95.79 
 
 		 1101 aa  2092    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  44.16 
 
 		 1067 aa  885    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  47.67 
 
 		 1219 aa  812    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  79.95 
 
 		 1100 aa  1806    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  42.49 
 
 		 1061 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  47.79 
 
 		 1221 aa  812    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  41.06 
 
 		 1188 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  42.22 
 
 		 1057 aa  628  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.67 
 
 		 1103 aa  512  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  33.3 
 
 		 1543 aa  499  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  40.23 
 
 		 3006 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  40.09 
 
 		 2140 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  39.83 
 
 		 3238 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  38.98 
 
 		 3286 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  38.42 
 
 		 2899 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  38.56 
 
 		 3521 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  37.93 
 
 		 2900 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  32.32 
 
 		 1059 aa  466  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  32.79 
 
 		 1159 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1159 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1158 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1158 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1157 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  34.63 
 
 		 1120 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1137 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  31.33 
 
 		 1157 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1159 aa  416  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1157 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1132 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1159 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  34.32 
 
 		 1116 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  34.29 
 
 		 1120 aa  413  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1132 aa  406  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  33.64 
 
 		 1116 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  34.59 
 
 		 1132 aa  406  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  32.14 
 
 		 1012 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  39.31 
 
 		 522 aa  337  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  29.83 
 
 		 881 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  27.37 
 
 		 837 aa  198  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  39.74 
 
 		 951 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  27.18 
 
 		 960 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  43.54 
 
 		 1093 aa  164  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  43.54 
 
 		 1093 aa  164  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  32.53 
 
 		 348 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  40.8 
 
 		 1830 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  30.68 
 
 		 2400 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  23.35 
 
 		 1644 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  25.41 
 
 		 1171 aa  49.7  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  21.81 
 
 		 918 aa  48.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  24.12 
 
 		 1915 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>