60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2426 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1092 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  59.85 
 
 		 1221 aa  1499    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  100 
 
 		 1188 aa  2417    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  40.48 
 
 		 1100 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  50.71 
 
 		 1061 aa  860    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  53.2 
 
 		 1067 aa  930    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  62.08 
 
 		 1219 aa  1540    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  62.05 
 
 		 2007 aa  1237    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  40.8 
 
 		 1101 aa  785    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1133 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  40.52 
 
 		 1057 aa  682    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  58.37 
 
 		 1194 aa  1379    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  50.23 
 
 		 1816 aa  1076    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  50.45 
 
 		 1341 aa  1089    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  46.73 
 
 		 1051 aa  763    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  34.21 
 
 		 1103 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  35.19 
 
 		 2140 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  34.9 
 
 		 3006 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  34.29 
 
 		 3238 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  34.29 
 
 		 3521 aa  399  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 		 3286 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  33.86 
 
 		 2899 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  33.57 
 
 		 2900 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  28.36 
 
 		 1543 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1137 aa  363  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  32.17 
 
 		 1116 aa  360  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1132 aa  357  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  30.24 
 
 		 1116 aa  355  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1159 aa  355  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  32.35 
 
 		 1132 aa  353  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1132 aa  353  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  29.83 
 
 		 1159 aa  350  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1157 aa  346  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  30.8 
 
 		 1120 aa  346  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1158 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1158 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1157 aa  343  8e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  30.57 
 
 		 1120 aa  342  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  32.63 
 
 		 1157 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1159 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1159 aa  340  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.95 
 
 		 1059 aa  324  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  35.4 
 
 		 522 aa  294  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  30.19 
 
 		 1012 aa  291  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  36.68 
 
 		 1093 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  36.68 
 
 		 1093 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  27.98 
 
 		 881 aa  195  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  35.71 
 
 		 951 aa  186  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.79 
 
 		 960 aa  166  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  28.21 
 
 		 837 aa  125  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  38.79 
 
 		 1830 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  35.9 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  26.74 
 
 		 2400 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.57 
 
 		 1644 aa  57.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  32.05 
 
 		 849 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  27.04 
 
 		 934 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  26.26 
 
 		 1915 aa  51.6  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  29.56 
 
 		 885 aa  48.9  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1583  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1329 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  33.86 
 
 		 885 aa  45.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>