19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1315 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 1221 aa  2456    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  100 
 
 		 1221 aa  2456    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1253 aa  625  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1153 aa  393  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1267  hypothetical protein  60.99 
 
 		 694 aa  390  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  34.14 
 
 		 1564 aa  328  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  30.4 
 
 		 849 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  24.26 
 
 		 885 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  23.47 
 
 		 885 aa  125  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  25.73 
 
 		 1915 aa  102  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1830 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  24.59 
 
 		 2400 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  22.91 
 
 		 1093 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  23.12 
 
 		 1093 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  25.82 
 
 		 934 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  32.17 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  26.64 
 
 		 1135 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  39.66 
 
 		 1543 aa  48.5  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  30.38 
 
 		 1188 aa  45.8  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>