26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1315 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1448    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  26.22 
 
 		 771 aa  163  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  24.48 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  24.58 
 
 		 694 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  25.32 
 
 		 590 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2739  hypothetical protein  23.74 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  29.75 
 
 		 934 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  23.5 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  23.5 
 
 		 680 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1153 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6201  hypothetical protein  22.2 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1221 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1221 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  31.61 
 
 		 2900 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  27.64 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  26.79 
 
 		 885 aa  58.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  29.59 
 
 		 2140 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  22.18 
 
 		 1093 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  21.96 
 
 		 1093 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  22.92 
 
 		 2400 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  30.05 
 
 		 3286 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  30.05 
 
 		 3521 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1253 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  28.5 
 
 		 2899 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 		 3238 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  23.79 
 
 		 1564 aa  44.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>