24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3601 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 694 aa  1415    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  30.6 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  24.84 
 
 		 702 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  25.97 
 
 		 771 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  25.43 
 
 		 680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  25.29 
 
 		 680 aa  120  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  25.22 
 
 		 733 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  28.26 
 
 		 934 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6201  hypothetical protein  23.13 
 
 		 721 aa  81.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1235  hypothetical protein  24.16 
 
 		 716 aa  78.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  24.49 
 
 		 1915 aa  71.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2739  hypothetical protein  22 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0979  hypothetical protein  27.98 
 
 		 239 aa  53.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  29.7 
 
 		 779 aa  51.2  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.64 
 
 		 1199 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  21.4 
 
 		 2400 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  30.91 
 
 		 2334 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1253 aa  48.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  21.96 
 
 		 1093 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  31.2 
 
 		 2900 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  31.48 
 
 		 1242 aa  44.7  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.22 
 
 		 9585 aa  44.3  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  21.61 
 
 		 1135 aa  44.3  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  31.46 
 
 		 1543 aa  44.3  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>