11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6201 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6201  hypothetical protein  100 
 
 		 721 aa  1466    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1235  hypothetical protein  33.6 
 
 		 716 aa  317  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  25.93 
 
 		 590 aa  98.2  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  22.37 
 
 		 694 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  23.85 
 
 		 680 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  24.08 
 
 		 680 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  21.99 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  23.64 
 
 		 733 aa  55.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  30.61 
 
 		 1135 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2739  hypothetical protein  24.83 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  31.36 
 
 		 934 aa  43.9  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>