15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0376 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0376  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1373    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1004  hypothetical protein  99.56 
 
 		 680 aa  1370    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  26.34 
 
 		 590 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  25.11 
 
 		 694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2739  hypothetical protein  26 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6201  hypothetical protein  24.19 
 
 		 721 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  23 
 
 		 1564 aa  72.8  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  23.5 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  22.4 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1235  hypothetical protein  23.27 
 
 		 716 aa  63.9  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  25.47 
 
 		 1915 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  24.84 
 
 		 934 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  23.56 
 
 		 771 aa  55.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_004310  BR0979  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  48.5  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1153 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>