18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3342 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 849 aa  1739    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  41 
 
 		 1564 aa  568  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0630  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1253 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1221 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1221 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1153 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  22.94 
 
 		 885 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  22.97 
 
 		 885 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  26.85 
 
 		 1915 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  32.05 
 
 		 1188 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  24.62 
 
 		 2400 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 3238 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  40.28 
 
 		 3521 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1830 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  24.42 
 
 		 1093 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  22.25 
 
 		 1093 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  44.64 
 
 		 3286 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.08 
 
 		 1221 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>