33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3437 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3437  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
1135 aa  2296    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230863  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2232  Phage-related protein tail component-like protein  30.66 
 
 
1915 aa  138  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  27.23 
 
 
934 aa  115  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  26.1 
 
 
1830 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0256  fibronectin type III domain-containing protein  25.74 
 
 
590 aa  77.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  26.36 
 
 
1093 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  25.94 
 
 
1093 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  25.88 
 
 
2400 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.73 
 
 
1462 aa  56.2  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  28.03 
 
 
692 aa  56.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2410  hypothetical protein  26.67 
 
 
733 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2990  hypothetical protein  27.14 
 
 
1153 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  24.77 
 
 
771 aa  52.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  31.47 
 
 
869 aa  52.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1315  hypothetical protein  26.64 
 
 
1221 aa  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.12495  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2085  hypothetical protein  26.64 
 
 
1221 aa  52  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.553705  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  29.59 
 
 
741 aa  51.6  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  28.33 
 
 
1401 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  41.84 
 
 
1199 aa  50.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6201  hypothetical protein  30.61 
 
 
721 aa  49.7  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  31.45 
 
 
458 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32 
 
 
458 aa  47.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  32.69 
 
 
5743 aa  47.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 
1401 aa  46.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 
1121 aa  46.2  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.28 
 
 
492 aa  46.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  35 
 
 
655 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.54 
 
 
6885 aa  45.8  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  32.86 
 
 
997 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  31.91 
 
 
970 aa  45.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.86 
 
 
1160 aa  45.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.65 
 
 
795 aa  44.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.33 
 
 
2334 aa  44.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>