22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3534 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 1438 aa  2908    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  30.78 
 
 		 1171 aa  288  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2669  hypothetical protein  49.3 
 
 		 214 aa  211  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1878  hypothetical protein  58.64 
 
 		 183 aa  161  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1583  hypothetical protein  25 
 
 		 1329 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0298  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1570 aa  145  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.620939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4100  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1032 aa  92.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  26.87 
 
 		 918 aa  89.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3363  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1017 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1579  hypothetical protein  24.04 
 
 		 999 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0218249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3721  hypothetical protein  26.54 
 
 		 774 aa  72  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.337138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2488  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.1 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6657  hypothetical protein  23.91 
 
 		 782 aa  65.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  31.18 
 
 		 3006 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  43.04 
 
 		 1830 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  44.44 
 
 		 2007 aa  55.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.07 
 
 		 1153 aa  54.3  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2314  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 288 aa  53.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.856278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1389  hypothetical protein  22.64 
 
 		 898 aa  49.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  29.19 
 
 		 729 aa  48.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  27.68 
 
 		 1644 aa  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3499  hypothetical protein  25.66 
 
 		 833 aa  46.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>