14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6657 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3721  hypothetical protein  49.41 
 
 		 774 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.337138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6657  hypothetical protein  100 
 
 		 782 aa  1588    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2984  tail fiber protein  42.82 
 
 		 1111 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  25.08 
 
 		 1171 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.73 
 
 		 918 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  26.84 
 
 		 1644 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3534  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1438 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3363  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1017 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1157 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1158 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1158 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1159 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1159 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  23.02 
 
 		 1157 aa  45.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>