47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2098 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  100 
 
 
320 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  83.02 
 
 
1007 aa  531  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  83.22 
 
 
281 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  77.22 
 
 
1120 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  74.52 
 
 
1137 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  58.44 
 
 
790 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  59.06 
 
 
569 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  59.06 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  74.14 
 
 
441 aa  341  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  58.13 
 
 
805 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  57.32 
 
 
791 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  77.59 
 
 
516 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  75.51 
 
 
536 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  61.45 
 
 
962 aa  278  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  65.93 
 
 
442 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  52.56 
 
 
580 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  42.48 
 
 
682 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  46.99 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.88 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  48 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  44.21 
 
 
557 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.68 
 
 
166 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  47.3 
 
 
259 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  35.34 
 
 
498 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  45.57 
 
 
179 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  45.57 
 
 
180 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  44.16 
 
 
646 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  58.82 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  37.29 
 
 
689 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  37.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  38.95 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  36.84 
 
 
176 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  39.58 
 
 
621 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  40.91 
 
 
402 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  49.02 
 
 
196 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  49.02 
 
 
183 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 
144 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  35.56 
 
 
530 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  26.26 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  37.66 
 
 
532 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  27.9 
 
 
735 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  25.42 
 
 
501 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  34.26 
 
 
157 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  32.23 
 
 
140 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 
140 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  24.62 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>