56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1817 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  100 
 
 
196 aa  410  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  58.67 
 
 
183 aa  241  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  49.66 
 
 
371 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  48.97 
 
 
485 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  45.68 
 
 
401 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  45.56 
 
 
498 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  38.97 
 
 
682 aa  131  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  47.37 
 
 
646 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  47.59 
 
 
557 aa  127  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  46.67 
 
 
689 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  44.65 
 
 
166 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  48.43 
 
 
621 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  47.18 
 
 
402 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  45 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  45.45 
 
 
259 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  42.24 
 
 
262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 
340 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  43.79 
 
 
176 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  43.12 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  40.72 
 
 
180 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  40.72 
 
 
179 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  36.84 
 
 
264 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.14 
 
 
144 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  36.11 
 
 
140 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  35.42 
 
 
140 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  36.62 
 
 
157 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  36.62 
 
 
532 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  36.96 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
530 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  44.44 
 
 
962 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  33.33 
 
 
441 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  43.08 
 
 
1137 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  49.3 
 
 
483 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  49.02 
 
 
320 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  50 
 
 
516 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  42.65 
 
 
1007 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  41.54 
 
 
1120 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  50 
 
 
536 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  34.78 
 
 
817 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  29.71 
 
 
225 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  50 
 
 
580 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  47.06 
 
 
281 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  31.21 
 
 
671 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  43.14 
 
 
569 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  38.46 
 
 
805 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  43.14 
 
 
463 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  38.46 
 
 
790 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  38.46 
 
 
442 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  30.09 
 
 
368 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  29.35 
 
 
323 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  35.37 
 
 
654 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  35.37 
 
 
654 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  28.57 
 
 
387 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  37.88 
 
 
791 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  36.67 
 
 
735 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.14 
 
 
492 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>