73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2111 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  100 
 
 		 1007 aa  1984    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  84.11 
 
 		 320 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  87.81 
 
 		 1137 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  88.52 
 
 		 1120 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  81.49 
 
 		 281 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  60.12 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  60.25 
 
 		 790 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  57.02 
 
 		 805 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  60 
 
 		 463 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  59.13 
 
 		 791 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  87.56 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  74.14 
 
 		 441 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  75.92 
 
 		 536 aa  349  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  80.11 
 
 		 401 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  80.11 
 
 		 401 aa  332  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  79.7 
 
 		 1258 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  62.99 
 
 		 962 aa  302  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  66.8 
 
 		 411 aa  295  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  63.33 
 
 		 442 aa  270  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  63.56 
 
 		 407 aa  265  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  63.16 
 
 		 451 aa  262  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  63.16 
 
 		 437 aa  261  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  62.75 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  63.16 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  62.35 
 
 		 438 aa  259  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  53.78 
 
 		 304 aa  258  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  62.75 
 
 		 439 aa  257  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  58.42 
 
 		 845 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  61.94 
 
 		 434 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  55.76 
 
 		 580 aa  243  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  90 
 
 		 198 aa  224  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  55.98 
 
 		 682 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  68.92 
 
 		 892 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  71.84 
 
 		 280 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  76 
 
 		 570 aa  134  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.6 
 
 		 697 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  65.59 
 
 		 583 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  58.33 
 
 		 493 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  29.82 
 
 		 180 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  29.82 
 
 		 179 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.88 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  68.85 
 
 		 670 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  68.85 
 
 		 670 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  42.42 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  59.76 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  63.93 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  36.89 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  45.21 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  43.16 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  44.58 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  58.82 
 
 		 401 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  45.95 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.68 
 
 		 166 aa  75.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  27.95 
 
 		 689 aa  75.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  37.4 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  27.84 
 
 		 645 aa  72  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  28.11 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  56.1 
 
 		 581 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  36.84 
 
 		 177 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  35.79 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  33.63 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  41.86 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  30.49 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  55.26 
 
 		 172 aa  62  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  60.34 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  32.44 
 
 		 762 aa  58.9  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  35.45 
 
 		 336 aa  57  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  39.1 
 
 		 690 aa  56.6  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01518  hypothetical protein  45.03 
 
 		 642 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.43941  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  33.22 
 
 		 2906 aa  53.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  24.58 
 
 		 735 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  39.19 
 
 		 501 aa  47.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>