30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1206 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01518  hypothetical protein  68.28 
 
 		 642 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.43941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  100 
 
 		 845 aa  1729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01508  predicted tail fiber protein  55.56 
 
 		 433 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  80.89 
 
 		 1007 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  58.79 
 
 		 1258 aa  251  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  58.94 
 
 		 401 aa  247  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  58.94 
 
 		 401 aa  247  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  73.05 
 
 		 411 aa  243  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  80.92 
 
 		 1137 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  96.69 
 
 		 198 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  88.43 
 
 		 1120 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  77.99 
 
 		 438 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  60.98 
 
 		 437 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  75.16 
 
 		 407 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  60.57 
 
 		 437 aa  220  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  74.52 
 
 		 451 aa  219  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  57.14 
 
 		 434 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  88.99 
 
 		 437 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  82.95 
 
 		 439 aa  214  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  76.06 
 
 		 790 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  75.35 
 
 		 791 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  74.65 
 
 		 892 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  73.94 
 
 		 805 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01353  hypothetical protein  39.57 
 
 		 251 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01342  conserved hypothetical protein  44.75 
 
 		 192 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  134  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  100 
 
 		 215 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  38.02 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  40 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  36.72 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>