86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1941 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  100 
 
 		 570 aa  1153    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  62.35 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  67.32 
 
 		 580 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  69.77 
 
 		 673 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.27 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  47.84 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  47.84 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  51.11 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  50.33 
 
 		 581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  49.54 
 
 		 493 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.82 
 
 		 697 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  49.75 
 
 		 554 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  80.77 
 
 		 516 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  80.77 
 
 		 536 aa  193  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  50.29 
 
 		 504 aa  181  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  36.99 
 
 		 485 aa  180  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  45.16 
 
 		 401 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  50 
 
 		 399 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  55.77 
 
 		 561 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  51.55 
 
 		 479 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  55.19 
 
 		 557 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  51.59 
 
 		 371 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  44.5 
 
 		 399 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  54.49 
 
 		 588 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  51.3 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  40.07 
 
 		 689 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  51.9 
 
 		 646 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  52.6 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  51.9 
 
 		 419 aa  157  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  65.87 
 
 		 962 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.9 
 
 		 714 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  49.37 
 
 		 340 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  53.79 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  45.45 
 
 		 689 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  61.43 
 
 		 790 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  50 
 
 		 892 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  46.53 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  60.71 
 
 		 791 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  76 
 
 		 1007 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  49.21 
 
 		 280 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  50 
 
 		 805 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  38.86 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  39.31 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  72.6 
 
 		 304 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.59 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  47.79 
 
 		 1120 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  48.25 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  41.47 
 
 		 442 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  46.9 
 
 		 1137 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  37.97 
 
 		 817 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  63.22 
 
 		 621 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.56 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  37.44 
 
 		 242 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00754  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10057  Tail fiber  74.6 
 
 		 87 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  62.96 
 
 		 462 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  35.57 
 
 		 382 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  34.88 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  37.91 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  29.68 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  34.59 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  43.41 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  71.7 
 
 		 701 aa  77  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  33.12 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  52.58 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  72.92 
 
 		 670 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  72.92 
 
 		 670 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  43.4 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  44.07 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  72.73 
 
 		 401 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  72.73 
 
 		 401 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  43.75 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  67.31 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  54 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  57.14 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  58.33 
 
 		 387 aa  54.7  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  49.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  50 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  43.33 
 
 		 682 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  30.66 
 
 		 525 aa  51.2  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  82.35 
 
 		 408 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  36.75 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  54.76 
 
 		 397 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  44.64 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 374 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.573397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  27.87 
 
 		 590 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>