85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1537 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 621 aa  1271    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  78.85 
 
 		 689 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  73.31 
 
 		 462 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  72.04 
 
 		 697 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  55.65 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  55.65 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.28 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  35.89 
 
 		 682 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  47.11 
 
 		 646 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  56.77 
 
 		 166 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  52.98 
 
 		 259 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  52.38 
 
 		 259 aa  155  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  36.86 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  47.95 
 
 		 498 aa  130  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  46.79 
 
 		 371 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  44.51 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  39.51 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  48.43 
 
 		 196 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  52.85 
 
 		 588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  45.96 
 
 		 179 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  45.96 
 
 		 180 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  44.05 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  41.92 
 
 		 401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  44.91 
 
 		 262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  48.25 
 
 		 532 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  47.92 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  44.9 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  45.68 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  45.68 
 
 		 176 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  44.37 
 
 		 140 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  53.27 
 
 		 399 aa  107  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  62.22 
 
 		 673 aa  107  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  63.22 
 
 		 570 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  43.59 
 
 		 402 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  44.2 
 
 		 463 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  46.51 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  43.48 
 
 		 962 aa  99.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  41.72 
 
 		 530 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  43.41 
 
 		 892 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  51.72 
 
 		 561 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  35.29 
 
 		 264 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  43.41 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  54.22 
 
 		 790 aa  77.4  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  44.96 
 
 		 805 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  58.11 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  60.81 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  31.11 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.81 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  33.73 
 
 		 385 aa  70.1  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.32 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  34.33 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  27.88 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  31.33 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  30.12 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  29.55 
 
 		 671 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  41.46 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  37.5 
 
 		 1007 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  63.46 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  39.74 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  39.74 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  39.74 
 
 		 1137 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  40.28 
 
 		 516 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  46.38 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  37.27 
 
 		 735 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  39.39 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  39.39 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  40.28 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  40.24 
 
 		 281 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  39.53 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  42.86 
 
 		 419 aa  57  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1223  hypothetical protein  49.02 
 
 		 145 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  41.79 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  28.83 
 
 		 323 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  29.92 
 
 		 282 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  28.04 
 
 		 527 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  34.31 
 
 		 368 aa  50.4  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  35.48 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  44.05 
 
 		 519 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  63.16 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 712 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.979712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  58.97 
 
 		 397 aa  47.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  67.86 
 
 		 670 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  67.86 
 
 		 670 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  38.14 
 
 		 514 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  38.14 
 
 		 520 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>