148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1106 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  100 
 
 
368 aa  763    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1105  Tail Collar domain protein  39.06 
 
 
200 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  34.29 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  31.38 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  29.52 
 
 
654 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  29.52 
 
 
654 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  24.26 
 
 
817 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  28.98 
 
 
178 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  40.54 
 
 
195 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  37.65 
 
 
181 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  39.19 
 
 
181 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  43.55 
 
 
170 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  49.09 
 
 
554 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  44.78 
 
 
173 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  47.54 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  46.97 
 
 
176 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  32.54 
 
 
282 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  37.93 
 
 
172 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  48.21 
 
 
225 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  41.56 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  52.38 
 
 
182 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  44.26 
 
 
167 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  43.94 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  44.83 
 
 
176 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  38.75 
 
 
175 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  43.64 
 
 
176 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  51.16 
 
 
163 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  36.73 
 
 
192 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  40.91 
 
 
172 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  28.11 
 
 
689 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  40 
 
 
174 aa  57.4  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  41.94 
 
 
163 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  28.57 
 
 
170 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  55.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0269  tail collar domain-containing protein  43.1 
 
 
78 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0994346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  28.57 
 
 
172 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  35 
 
 
207 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  37.66 
 
 
173 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  50.94 
 
 
205 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  48.84 
 
 
157 aa  56.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  45.16 
 
 
171 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  44.26 
 
 
167 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  42.11 
 
 
196 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  33.72 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  37.84 
 
 
189 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  33.72 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  44.62 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  34.04 
 
 
171 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  33.72 
 
 
199 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  31.43 
 
 
300 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  37.84 
 
 
189 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  47.62 
 
 
169 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  26.97 
 
 
176 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  52.38 
 
 
168 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  52.38 
 
 
179 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  42.59 
 
 
171 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  29.88 
 
 
224 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  42.31 
 
 
175 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  50 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  35.35 
 
 
199 aa  54.3  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 
177 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  43.1 
 
 
195 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 
179 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  32.56 
 
 
199 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  47.62 
 
 
184 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  37.7 
 
 
166 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  29.29 
 
 
206 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  52.38 
 
 
204 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  36.62 
 
 
182 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  38.16 
 
 
173 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  42.62 
 
 
176 aa  53.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  36.07 
 
 
211 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  42.11 
 
 
264 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  45.24 
 
 
183 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2884  Tail Collar domain protein  54.76 
 
 
81 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000266476  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  39.66 
 
 
80 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  37.7 
 
 
169 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  53.66 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  40.98 
 
 
195 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  46.51 
 
 
173 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  42.31 
 
 
180 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2344  Tail Collar domain protein  48.72 
 
 
82 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  42.86 
 
 
183 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
170 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  35.14 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  44 
 
 
186 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  42.65 
 
 
175 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  34.31 
 
 
621 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  44.23 
 
 
203 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  37.7 
 
 
181 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  35.56 
 
 
199 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  39.62 
 
 
197 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  35 
 
 
530 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 
173 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  37.7 
 
 
181 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  40.74 
 
 
196 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  38.89 
 
 
180 aa  49.3  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  35.21 
 
 
181 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>