57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3393 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  100 
 
 		 519 aa  1064    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  33.01 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  32.58 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  32.12 
 
 		 646 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  33.15 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  33.33 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  35.85 
 
 		 583 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  28.96 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  33.16 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  33.16 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  28.96 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  33.68 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  33.75 
 
 		 660 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  31.9 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  33.91 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  30.26 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  32.3 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  28.96 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  31.02 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  36.94 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  31.28 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  32.64 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  32.69 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  30.39 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  34.27 
 
 		 673 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  31.58 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  33.57 
 
 		 580 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  30.29 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.9 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  33.12 
 
 		 570 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  36.73 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  29.23 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  34.44 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  34 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  28.66 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  29.87 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  29.65 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  27.42 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  28.75 
 
 		 691 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  29.41 
 
 		 259 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  33.06 
 
 		 140 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  26.17 
 
 		 689 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  32.82 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  27.66 
 
 		 382 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  33.11 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  28.38 
 
 		 525 aa  50.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  28.92 
 
 		 259 aa  50.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  44.05 
 
 		 621 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  26.49 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  38.1 
 
 		 682 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  35.09 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  35.09 
 
 		 157 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  40 
 
 		 527 aa  47  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  43.1 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  41.25 
 
 		 200 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  40.82 
 
 		 306 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  32.23 
 
 		 299 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>