30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1303 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  55.62 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  91.95 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  33.73 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  56.25 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  56.25 
 
 		 540 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  47.37 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0301  putative tail fiber protein  52.11 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  38.94 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  38.94 
 
 		 520 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  42.05 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  36.08 
 
 		 817 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  50.94 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.07 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  48.21 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1051  hypothetical protein  36.15 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  38.2 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  38.2 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  42.31 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  82.76 
 
 		 264 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  38.98 
 
 		 505 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  35.71 
 
 		 419 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  41.25 
 
 		 519 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0935  hypothetical protein  40.38 
 
 		 393 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  35 
 
 		 430 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  32.86 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  34.62 
 
 		 290 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  39.73 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  48.84 
 
 		 399 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  36.56 
 
 		 298 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>