78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2731 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  99.61 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  95.28 
 
 
238 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  45.9 
 
 
262 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  58.58 
 
 
166 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  55.77 
 
 
340 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  58.97 
 
 
682 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  57.52 
 
 
689 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  58.17 
 
 
646 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  52.38 
 
 
621 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  52.07 
 
 
177 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  48.84 
 
 
180 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  48.84 
 
 
179 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  51.79 
 
 
176 aa  148  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  52.29 
 
 
557 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  47.75 
 
 
401 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  50.89 
 
 
498 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  50.98 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  48.75 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  45.51 
 
 
402 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  44.1 
 
 
183 aa  122  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  57.94 
 
 
363 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  45.45 
 
 
196 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  45.28 
 
 
532 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  44.67 
 
 
140 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  46.54 
 
 
157 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  43.42 
 
 
140 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  40.83 
 
 
530 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  38.03 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  58.21 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  57.89 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  48.65 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  47.37 
 
 
1137 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  47.37 
 
 
1120 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  39.22 
 
 
962 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.1 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  47.37 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  46.67 
 
 
1007 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  47.3 
 
 
516 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  47.3 
 
 
536 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  47.3 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  32.5 
 
 
817 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  32.63 
 
 
580 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  34.36 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  30 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  32.63 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  30.57 
 
 
569 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  29.79 
 
 
790 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  29.79 
 
 
805 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  35.71 
 
 
554 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  41.77 
 
 
442 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  49.28 
 
 
483 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  42.27 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  28.8 
 
 
791 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  37.5 
 
 
654 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  37.5 
 
 
654 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  31.11 
 
 
527 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  27.95 
 
 
671 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  30.56 
 
 
472 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  29.9 
 
 
519 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  36.63 
 
 
790 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 
735 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  31.3 
 
 
368 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  35.63 
 
 
536 aa  48.9  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 
492 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  39.29 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  35.48 
 
 
383 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  31.25 
 
 
430 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  38.18 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  30.59 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  30.61 
 
 
364 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  38.57 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  33.33 
 
 
469 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  39.58 
 
 
168 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  33.93 
 
 
400 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  34.92 
 
 
408 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  38.2 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>