68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1478 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  90.49 
 
 		 516 aa  924    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  100 
 
 		 536 aa  1077    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  79.4 
 
 		 1137 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  66.92 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  46.89 
 
 		 962 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  75.1 
 
 		 1007 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  75.4 
 
 		 1120 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  75.9 
 
 		 281 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  75.51 
 
 		 320 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  84.24 
 
 		 172 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  38.45 
 
 		 790 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  35.48 
 
 		 463 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  54.88 
 
 		 569 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  54.51 
 
 		 580 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  53.66 
 
 		 791 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  40.9 
 
 		 892 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  80.77 
 
 		 570 aa  193  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  57.24 
 
 		 514 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  57.64 
 
 		 520 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  67.96 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  58.71 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  52.6 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  52.9 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  48.92 
 
 		 581 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  56.99 
 
 		 701 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  48.81 
 
 		 557 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  49.32 
 
 		 682 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  36.59 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.1 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 		 259 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  46.58 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  49.25 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  44.16 
 
 		 646 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  44.87 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  44.87 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  58 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  37.82 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  38.82 
 
 		 262 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  75 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  75 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  41.03 
 
 		 177 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  34.74 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.37 
 
 		 621 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  44.29 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  84.21 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.56 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  56.06 
 
 		 469 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  44.21 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  80 
 
 		 805 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  28.46 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  80 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  83.33 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  53.73 
 
 		 670 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  53.73 
 
 		 670 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  70 
 
 		 673 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  37.18 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  71.43 
 
 		 554 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  37.66 
 
 		 157 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 		 140 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  67.57 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  75 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  24.74 
 
 		 323 aa  43.5  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>