27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1045 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  100 
 
 		 690 aa  1418    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  45.48 
 
 		 670 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  49.16 
 
 		 701 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  45.48 
 
 		 670 aa  280  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  43.27 
 
 		 654 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  42.91 
 
 		 654 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  36.11 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  40.57 
 
 		 808 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  41.67 
 
 		 768 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  41.07 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  37.86 
 
 		 612 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  34.69 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  36.1 
 
 		 465 aa  180  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  36.1 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  33.57 
 
 		 609 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  44.3 
 
 		 268 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  31.85 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  34.31 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  39.19 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  43.75 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  39.82 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  38.76 
 
 		 1007 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  44.21 
 
 		 536 aa  56.2  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  44.21 
 
 		 516 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  33.1 
 
 		 580 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  59.09 
 
 		 1120 aa  44.3  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  59.09 
 
 		 1137 aa  44.3  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>