19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1037 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1248    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0739  hypothetical protein  58.92 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.495796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0698  hypothetical protein  58.92 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  37.86 
 
 		 690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  37.58 
 
 		 670 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  37.25 
 
 		 670 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  37.25 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  38.32 
 
 		 589 aa  170  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  40.29 
 
 		 531 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  35.31 
 
 		 804 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  34.4 
 
 		 768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  27.82 
 
 		 654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  27.82 
 
 		 654 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  28.21 
 
 		 808 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  27.94 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  26.37 
 
 		 527 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  28.25 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  34.06 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  26.01 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>