45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0914 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  100 
 
 		 589 aa  1202    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  74.45 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  61.46 
 
 		 531 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  77.81 
 
 		 363 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  46.67 
 
 		 670 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  46.67 
 
 		 670 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  46.75 
 
 		 701 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  36.11 
 
 		 690 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  41.78 
 
 		 768 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  37.43 
 
 		 654 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  37.13 
 
 		 654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  38.6 
 
 		 804 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  38.83 
 
 		 465 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  35.76 
 
 		 527 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  38.32 
 
 		 612 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  33.33 
 
 		 808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  38.43 
 
 		 609 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  37.58 
 
 		 268 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  44.96 
 
 		 249 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  49.48 
 
 		 479 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  43.22 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  43.09 
 
 		 580 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2185  hypothetical protein  53.85 
 
 		 95 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  44.07 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  53.12 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  64 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  46.59 
 
 		 673 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  62 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  46.91 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  26.87 
 
 		 190 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  58.54 
 
 		 660 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  42.22 
 
 		 469 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  61.9 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  69.23 
 
 		 1007 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  67.57 
 
 		 172 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  54.84 
 
 		 962 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  44.26 
 
 		 238 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  67.57 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  67.57 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  68.75 
 
 		 280 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  68.75 
 
 		 892 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  68.75 
 
 		 805 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  61.54 
 
 		 1137 aa  43.9  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  61.54 
 
 		 1120 aa  43.9  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>