18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0740 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  100 
 
 
804 aa  1642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  70.76 
 
 
768 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  41.07 
 
 
690 aa  206  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  38.85 
 
 
670 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  38.85 
 
 
670 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  38.85 
 
 
701 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  38.6 
 
 
589 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  36.39 
 
 
527 aa  180  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  39.3 
 
 
465 aa  180  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  35.31 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  36.43 
 
 
531 aa  161  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  35.13 
 
 
654 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  35.13 
 
 
654 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  34.88 
 
 
808 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  46.67 
 
 
268 aa  144  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  35.31 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  42.75 
 
 
249 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  31.37 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.2378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>