41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00752 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  100 
 
 
401 aa  764    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  764    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  86.67 
 
 
1007 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  74.61 
 
 
1258 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  61.13 
 
 
411 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  86.32 
 
 
1137 aa  269  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  87.37 
 
 
1120 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  60.32 
 
 
437 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  59.92 
 
 
407 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  59.92 
 
 
437 aa  245  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  59.51 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  59.92 
 
 
437 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  58.94 
 
 
438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  59.11 
 
 
434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  59.51 
 
 
439 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  62.28 
 
 
892 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  60.86 
 
 
845 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.116414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  83.64 
 
 
198 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  72.22 
 
 
791 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  71.53 
 
 
790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  72.22 
 
 
805 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  69.35 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  62.67 
 
 
570 aa  71.2  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  82.93 
 
 
673 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  75 
 
 
516 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  43.02 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  75 
 
 
536 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  35.97 
 
 
468 aa  63.5  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  68.89 
 
 
463 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  55.74 
 
 
962 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  58.18 
 
 
580 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  36.36 
 
 
336 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  54.39 
 
 
552 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  64.44 
 
 
645 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  62.5 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  60.47 
 
 
172 aa  50.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  74.36 
 
 
583 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  30.8 
 
 
762 aa  46.6  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  48.19 
 
 
493 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01518  hypothetical protein  53.1 
 
 
642 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.43941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  56.82 
 
 
581 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>