35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1250 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  98.07 
 
 		 414 aa  845    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  99.74 
 
 		 387 aa  795    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 414 aa  859    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  45.1 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1245  Ig-like domain-containing protein  46.03 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2930  Ig-like domain-containing protein  41.33 
 
 		 593 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  33.7 
 
 		 414 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  29.29 
 
 		 790 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  26.52 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.24 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  30.07 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  31.54 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  34.62 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  39.33 
 
 		 654 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  42.11 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  39.33 
 
 		 654 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  53.19 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  47.17 
 
 		 282 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  28.74 
 
 		 536 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  32.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  45.61 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  34.51 
 
 		 199 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  34.51 
 
 		 199 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  33.61 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  34.51 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  34.51 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  27.86 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  35.56 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  28.57 
 
 		 157 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  34.78 
 
 		 182 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  47.5 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  35.16 
 
 		 163 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  29.73 
 
 		 170 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>