40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1105 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1105  Tail Collar domain protein  100 
 
 
200 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  39.06 
 
 
368 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  29.38 
 
 
323 aa  53.9  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  33.61 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  40 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  43.86 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  40.45 
 
 
264 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  30.51 
 
 
483 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  30.84 
 
 
157 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  30.08 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  25.56 
 
 
262 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  27.8 
 
 
735 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  35.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  43.75 
 
 
204 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  40.68 
 
 
175 aa  45.1  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  35.94 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  26.98 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  38.71 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  26.8 
 
 
671 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  32.14 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  37.93 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  25 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  35.9 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  37.93 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  32.31 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  30.1 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  34.43 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  25 
 
 
654 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  25 
 
 
654 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  29.51 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  34.25 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  39.66 
 
 
167 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  41.38 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  35.38 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  41.38 
 
 
195 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  40 
 
 
195 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  32 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  36.21 
 
 
171 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>