133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4954 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  100 
 
 
171 aa  347  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  63.43 
 
 
173 aa  219  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  61.05 
 
 
173 aa  213  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  60.95 
 
 
171 aa  209  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  55.43 
 
 
176 aa  192  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  52.25 
 
 
179 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  58.62 
 
 
175 aa  191  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  53.49 
 
 
168 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  54.29 
 
 
175 aa  187  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  52.58 
 
 
189 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  50 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  53.44 
 
 
183 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  52.06 
 
 
189 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  50.57 
 
 
176 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  52.07 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  52.02 
 
 
169 aa  177  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  49.71 
 
 
169 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 
199 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 
199 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  52.3 
 
 
172 aa  175  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  47.47 
 
 
199 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 
199 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  47.37 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  45.98 
 
 
174 aa  169  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  50.29 
 
 
163 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  53.41 
 
 
173 aa  166  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  48.33 
 
 
181 aa  165  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  51.45 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  50 
 
 
180 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  48.55 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  47.98 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  47.98 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  44.57 
 
 
176 aa  161  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  47.02 
 
 
199 aa  161  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  45.81 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  46.47 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  48.57 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  46.2 
 
 
182 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  49.1 
 
 
170 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  49.71 
 
 
173 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  48.82 
 
 
165 aa  157  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  45.56 
 
 
180 aa  157  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  46.67 
 
 
181 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  46.2 
 
 
173 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  44.2 
 
 
182 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  44.97 
 
 
172 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  46.33 
 
 
179 aa  154  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  45 
 
 
179 aa  153  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  44.07 
 
 
180 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  42.13 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  44.44 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  46.78 
 
 
167 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  43.3 
 
 
196 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  40.88 
 
 
183 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  44.04 
 
 
195 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  45.95 
 
 
181 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  47.43 
 
 
176 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  46.01 
 
 
163 aa  147  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  46.2 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  41.62 
 
 
176 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  46.02 
 
 
175 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  42.62 
 
 
181 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  46.74 
 
 
173 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  44.97 
 
 
166 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  46.02 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  42.22 
 
 
205 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  38.64 
 
 
177 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  40.68 
 
 
178 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  43.53 
 
 
199 aa  137  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  43.27 
 
 
197 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  44.3 
 
 
157 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  40.54 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  40.56 
 
 
186 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  40.34 
 
 
177 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  41.71 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  39.15 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  38.35 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  40.21 
 
 
184 aa  128  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  39.23 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  39.49 
 
 
195 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  37.68 
 
 
207 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  37.76 
 
 
195 aa  120  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 
172 aa  117  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  35.03 
 
 
196 aa  111  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  44 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  42.31 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  37.14 
 
 
211 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  47.96 
 
 
210 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  66.13 
 
 
80 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  31.25 
 
 
209 aa  94.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  63.93 
 
 
80 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  37.43 
 
 
264 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  32.43 
 
 
224 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  30.54 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  66.07 
 
 
84 aa  85.1  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0595  phage tail collar domain-containing protein  65.57 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  31.55 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  40.21 
 
 
270 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  51.61 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  48.33 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>