131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0703 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  100 
 
 
264 aa  537  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  39.88 
 
 
181 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  37.65 
 
 
195 aa  95.5  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  39.26 
 
 
172 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  36.57 
 
 
176 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  37.13 
 
 
173 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  31.02 
 
 
205 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  37.06 
 
 
178 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  36.69 
 
 
176 aa  92.4  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  34.5 
 
 
177 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  37.43 
 
 
171 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  33.14 
 
 
180 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  37.13 
 
 
170 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  36.69 
 
 
172 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  34.55 
 
 
173 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  34.55 
 
 
174 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  34.27 
 
 
180 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  34.44 
 
 
196 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  36.53 
 
 
176 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  35.98 
 
 
169 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  35.29 
 
 
175 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  37.33 
 
 
163 aa  85.9  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  34.73 
 
 
169 aa  85.5  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  35.19 
 
 
171 aa  85.5  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  35.67 
 
 
157 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  34.57 
 
 
166 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  32.24 
 
 
195 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  35.88 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  37.34 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  34.55 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  35.93 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  31.03 
 
 
181 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  36.54 
 
 
180 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  34.73 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  32.98 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  32.98 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  32.98 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  35.15 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  32.98 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  43 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  34.25 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  34.25 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  37.58 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  41.75 
 
 
199 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  35.8 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  36.84 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  32.53 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  30.37 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  34.5 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  42.59 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  35.22 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  32.53 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  33.53 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  39.18 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  35.06 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  35.92 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  34.44 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  34.66 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  38.14 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  33.73 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  33.12 
 
 
671 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  42.42 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  34.76 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  41.84 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  28.42 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  38.52 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  39.64 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  38.14 
 
 
181 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  45.24 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  31.32 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  48 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  34.86 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  35.98 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  48.65 
 
 
554 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  33.77 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  37.4 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  29.22 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  30.6 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  30.81 
 
 
166 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  42.57 
 
 
310 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  38.1 
 
 
183 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  32.57 
 
 
492 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  37.5 
 
 
181 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  31.68 
 
 
183 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  34.02 
 
 
183 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  32.21 
 
 
165 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  31.4 
 
 
167 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  39.22 
 
 
654 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  39.22 
 
 
654 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  33.12 
 
 
176 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  40.48 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  38.82 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  39.39 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  36.9 
 
 
187 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  36.17 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  30.72 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>