41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1182 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1269    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  64.64 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  65.45 
 
 		 608 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  67.03 
 
 		 476 aa  340  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  47.14 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  45.11 
 
 		 360 aa  194  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  44.68 
 
 		 360 aa  193  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  46.79 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  47.51 
 
 		 358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  43.93 
 
 		 278 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  45.41 
 
 		 278 aa  188  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  45.16 
 
 		 360 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  45.21 
 
 		 554 aa  180  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  47.39 
 
 		 336 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  45.66 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  46.5 
 
 		 555 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  46.5 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  46.5 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  41.76 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  42.12 
 
 		 433 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  44 
 
 		 555 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  40.2 
 
 		 455 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  58.41 
 
 		 423 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  53.7 
 
 		 117 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1097 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  52.34 
 
 		 232 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  46.49 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  43.24 
 
 		 150 aa  90.5  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  38.79 
 
 		 235 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  40.3 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  45.87 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  44.04 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  43.52 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  44.57 
 
 		 307 aa  73.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  36.54 
 
 		 152 aa  72  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  25.69 
 
 		 118 aa  59.3  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  25.69 
 
 		 117 aa  58.5  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  38.37 
 
 		 240 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  36.84 
 
 		 525 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  32.43 
 
 		 590 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  28.4 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>