43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1427 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  942    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  67.03 
 
 		 640 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  64.38 
 
 		 611 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  68.49 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  49.09 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  47.96 
 
 		 358 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  44.95 
 
 		 360 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  46.46 
 
 		 544 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  44.5 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  42.99 
 
 		 360 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  42.53 
 
 		 278 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  42.99 
 
 		 278 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  45.25 
 
 		 418 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  43.78 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1932  hypothetical protein  40.7 
 
 		 288 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  44.44 
 
 		 555 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  44.44 
 
 		 555 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  44.44 
 
 		 555 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  40.8 
 
 		 336 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  42.93 
 
 		 555 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  45.5 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  45.5 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  43.98 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  59.29 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1725  hypothetical protein  36.58 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  hitchhiker  0.0022695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  46.02 
 
 		 238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  49.06 
 
 		 232 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  45.05 
 
 		 150 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  38.39 
 
 		 235 aa  90.1  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  51.35 
 
 		 233 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  38.93 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  42.2 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  39.39 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  35.65 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  42.39 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6581  hypothetical protein  27.4 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  27.2 
 
 		 590 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  43.02 
 
 		 240 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  25.69 
 
 		 118 aa  60.5  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  25.69 
 
 		 117 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  34.21 
 
 		 525 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  26.25 
 
 		 341 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>